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學校以培養德智體美勞全面發展、具有民族精神和社會責任感、具有國際視野和合作競爭意識、具有科學精神和人文素養、具有創新意識和實踐能力的高素質創新型人才為目標，以造就國家海洋事業的領軍人才和骨干力量為特殊使命。學校遵循“通識為體，專業為用”的本科教育理念，實行有限條件的自主選課制度和學業識別與畢業專業識別確認制度，努力培養復合型、高素質人才。畢業生中已有16人當選中國科學院或中國工程院院士，4人先后擔任國家海洋局局長，參加中國第一次南極考察的75位科學家中一半以上是學校畢業生。